故事发生在解放战争时期。我党特工燕文川（刘小锋 饰）带秘密任务座火车赶赴老家江城，岂料刚刚到家，一场突如其来的劫难让他陷入国共两党斗争的漩涡。由于燕文川直属中共上层领导，江城的地下党组织并不知道他的身份，所以将他暂时扣押，把他交给留苏归来的女干部窦婉茹（黄曼 饰）处理。窦假扮保姆进入燕家，密切注视着燕文川的举动，但老牌特工燕文川怎么会看不出其中端倪，他以不变应万变，而性格冲动的婉茹则常自露马脚。江城军统头子陈恭如（宁晓志 饰）赏识燕文川的才干，在娄海平（任柯诺 饰）引荐下，将燕招入麾下。从此，燕文川开始了

故事讲述了归来的吴魏、刘骁等人深感责任重大，带领临时成立的特别行动小组为了解救被困孤岛的人质，潜入百名暴徒的聚集点，利用丰富的知识和专业技能制作出战斗武器，冒着枪林弹雨潜入敌营，炸掉军火库，与犯罪分子惨烈对决的故事。 作为一部现代军事战争类型动作电影，《卸甲归来》不仅展现了退伍军人为守护公民生命财产安全与极端犯罪分子殊死搏斗的英勇无畏的精神，而且在惊险刺激的动作戏、爆破场面之外，更着重表现动荡环境下人性的复杂，战争对人的影响，传达反战思想，呼吁和平，从而激发出观众的爱国情怀。